More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2389 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2389  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 198 aa  383  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372356 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2454  lysine exporter protein LysE/YggA  56.19 
 
 		 202 aa  219  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000409233  normal  0.559989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.94 
 
 		 196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3069  lysine exporter protein LysE/YggA  55.61 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2074  lysine exporter protein LysE/YggA  57.65 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3266  lysine exporter protein LysE/YggA  57.14 
 
 		 194 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.64518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2238  hypothetical protein  54.4 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26340  hypothetical protein  54.4 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.56622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2429  lysine exporter protein LysE/YggA  56.12 
 
 		 194 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.716497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 207 aa  124  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 		 205 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  34.41 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  33.87 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  34.03 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  34.04 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  32.29 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  32.81 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  32.81 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  32.8 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  32.8 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  32.81 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  32.8 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  32.8 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  32.8 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.81 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  32.8 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  32.81 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  35.39 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 197 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 203 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 197 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  32.26 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  32.81 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  32.63 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  32.63 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  35.26 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  31.61 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  31.09 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  32.8 
 
 		 640 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  35.48 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  31.77 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  28.49 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.49 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  29.83 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  30.94 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  31.67 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  29.47 
 
 		 206 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2478  hypothetical protein  32.46 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.609748 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3854  lysine exporter protein LysE/YggA  32.97 
 
 		 197 aa  94.4  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  31.15 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.68 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.35 
 
 		 201 aa  91.7  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4317  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381114  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1690  LysE family protein, putative  30.69 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2498  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0255081  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  26.56 
 
 		 204 aa  87.8  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  33.33 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30 
 
 		 216 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  32.4 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  32.4 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  30.34 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  32.4 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3236  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.748057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2435  lysine exporter protein LysE/YggA  32.64 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4085  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4281  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1731  lysine exporter protein LysE/YggA  29.59 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.12 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1235  lysine exporter protein LysE/YggA  30.57 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0243337  normal  0.0393722 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.95 
 
 		 196 aa  85.1  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  29.26 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06913  putative threonine efflux protein  29.57 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3706  lysine exporter protein LysE/YggA  29.44 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1213  transporter, LysE family  29.69 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3438  lysine exporter protein LysE/YggA  34.9 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  31.69 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000909  putative threonine efflux protein  28.49 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.850609  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4184  lysine exporter protein LysE/YggA  29.8 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  30.05 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2504  efflux protein, LysE family  31.11 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>