More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2429 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2429  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 194 aa  354  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.716497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3266  lysine exporter protein LysE/YggA  97.42 
 
 		 194 aa  283  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.64518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2074  lysine exporter protein LysE/YggA  93.81 
 
 		 194 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3069  lysine exporter protein LysE/YggA  80.31 
 
 		 194 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2454  lysine exporter protein LysE/YggA  47.69 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000409233  normal  0.559989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2389  lysine exporter protein LysE/YggA  56.67 
 
 		 198 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372356 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.13 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2238  hypothetical protein  48.33 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26340  hypothetical protein  49.44 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.56622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  40.72 
 
 		 207 aa  121  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  35.83 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  35.68 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  37.43 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  35.87 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  35.87 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  35.87 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  35.87 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  35.87 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  35.87 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  37.7 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2478  hypothetical protein  42.27 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.609748 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  35.33 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  34.07 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 208 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  37.78 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  35.45 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  34.21 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.22 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  35.16 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.61 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  39.23 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  32.97 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  35.87 
 
 		 640 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  35.26 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  32.42 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  32.42 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  32.42 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  32.24 
 
 		 197 aa  97.8  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 		 207 aa  97.8  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  32.79 
 
 		 197 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  28.57 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4317  lysine exporter protein LysE/YggA  40.23 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381114  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  32.79 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.79 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  32.79 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  35.45 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  31.69 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 		 209 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 		 209 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3854  lysine exporter protein LysE/YggA  38.12 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1690  LysE family protein, putative  36.76 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  38.33 
 
 		 212 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  33.89 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2504  efflux protein, LysE family  34.68 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3236  lysine exporter protein LysE/YggA  38.73 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.748057 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4281  lysine exporter protein LysE/YggA  40.11 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  35.43 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4085  lysine exporter protein LysE/YggA  40.11 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2498  lysine exporter protein LysE/YggA  40.22 
 
 		 199 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0255081  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2435  lysine exporter protein LysE/YggA  40.22 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0034  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.55 
 
 		 195 aa  91.3  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  33.15 
 
 		 199 aa  91.3  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  33.89 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  34.54 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1731  lysine exporter protein LysE/YggA  37.85 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  33.88 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  34.66 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3706  lysine exporter protein LysE/YggA  39.66 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3087  amino acid transporter LysE  29.28 
 
 		 197 aa  88.2  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0525749  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2325  lysine exporter protein LysE/YggA  41.9 
 
 		 215 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  32.99 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4184  lysine exporter protein LysE/YggA  39.11 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  35.79 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3106  hypothetical protein  35.83 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3438  lysine exporter protein LysE/YggA  40.78 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000909  putative threonine efflux protein  31.32 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.850609  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06913  putative threonine efflux protein  31.49 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  36.11 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10300  putative efflux protein  34.78 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0350881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.03 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1384  lysine exporter protein LysE/YggA  35.88 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  34.24 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  32.14 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2265  lysine exporter protein LysE/YggA  28.42 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499699  normal  0.537594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>