More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2463 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2463  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 195 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.152581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0017  lysine exporter protein LysE/YggA  52.36 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0934766  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.15 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  28.74 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  27.13 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  28.74 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  30.82 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  30.82 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  31.06 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  30.68 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  27.43 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  29.84 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  28.98 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  27.87 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  27.87 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  28.42 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0272  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.21 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  27.47 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  27.47 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  27.47 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  27.47 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  27.47 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  27.47 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2135  lysine exporter protein LysE/YggA  31.61 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1471  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  27.69 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.95 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0313  hypothetical protein  29.89 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0254408  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1658  hypothetical protein  29.89 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199082  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  26.18 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  30.57 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1461  hypothetical protein  29.89 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2447  hypothetical protein  29.89 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2583  amino acid transporter LysE  29.89 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515909  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0280  hypothetical protein  29.89 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0885  amino acid transporter LysE  29.89 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  27.03 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  26.92 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0577  hypothetical protein  28.34 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  24.86 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  26.2 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  29.26 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  33.54 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4912  lysine exporter protein LysE/YggA  27.57 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.15938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.86 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  27.03 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  29.57 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.06 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  27.17 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0850  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0203758  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  31.17 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  28.25 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  27.84 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  29.21 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.74 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  27.87 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  27.87 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  25.43 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.54 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  25.77 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  27.43 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0822  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.78 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  32.78 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  25.65 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.59 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  26.32 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  24.43 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  27.84 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  26.86 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  27.84 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  29.59 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.27 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  29.89 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.41 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4254  lysine exporter protein LysE/YggA  32.77 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.38 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2454  lysine exporter protein LysE/YggA  28.24 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000409233  normal  0.559989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1462  LysE family transport protein  35.2 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0346145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  26.47 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  24.74 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4501  lysine exporter protein (LysE/YggA)  32.23 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135665 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  27.16 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  26.67 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  24.74 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  23.76 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3860  lysine exporter protein LysE/YggA  33.61 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000283394 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  24.74 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  24.74 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.18 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  29.32 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  26.09 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.4 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>