More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4912 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4912  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 213 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.15938 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4501  lysine exporter protein (LysE/YggA)  92.49 
 
 		 214 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4254  lysine exporter protein LysE/YggA  84.98 
 
 		 214 aa  363  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3118  lysine exporter protein LysE/YggA  84.98 
 
 		 235 aa  364  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0850  lysine exporter protein LysE/YggA  82.78 
 
 		 211 aa  349  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0203758  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3860  lysine exporter protein LysE/YggA  82.55 
 
 		 213 aa  343  8e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000283394 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001442  threonine efflux protein  72.46 
 
 		 210 aa  268  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0237  hypothetical protein  65.55 
 
 		 209 aa  265  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06278  putative threonine efflux protein  71.98 
 
 		 210 aa  261  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1186  putative lysine exporter protein  70.05 
 
 		 211 aa  256  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  37.43 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  36.41 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  36.41 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  36.92 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  36.41 
 
 		 204 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  35.44 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.78 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  39.64 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  39.64 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  39.64 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  39.64 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  39.52 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.91 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  34.36 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  34.36 
 
 		 204 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.43 
 
 		 208 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  34.87 
 
 		 227 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.88 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  34.87 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  34.87 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  34.47 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  34.36 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  33.98 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.54 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  35.58 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  32.65 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  32.65 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 242 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.47 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  37.91 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.97 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.16 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  30.29 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.86 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.16 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  32.84 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  32.98 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  36.31 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  33.17 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.75 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.24 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.28 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.35 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.47 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.87 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.79 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5050  lysine exporter protein LysE/YggA  35.12 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.637848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  33.96 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.96 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.23 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.8 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  36.46 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  32.09 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  31.37 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.9 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1108  lysine exporter protein LysE/YggA  34.22 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  33.97 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.54 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.86 
 
 		 199 aa  88.2  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.03 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  33.53 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  31.82 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  34.72 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.83 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  30.43 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.43 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  30.43 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  30.43 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>