More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2447 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0313  hypothetical protein  99.49 
 
 		 197 aa  373  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0254408  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2583  amino acid transporter LysE  100 
 
 		 197 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515909  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1658  hypothetical protein  99.49 
 
 		 197 aa  373  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199082  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0280  hypothetical protein  99.49 
 
 		 208 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0885  amino acid transporter LysE  100 
 
 		 197 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2447  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1461  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0577  hypothetical protein  92.89 
 
 		 197 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0272  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.5 
 
 		 204 aa  124  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0822  lysine exporter protein LysE/YggA  29.89 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2015  hypothetical protein  29.61 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  31.22 
 
 		 640 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.85 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  31.46 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  32.6 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  33.15 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.16 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  31.35 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  32.78 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  28.35 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2526  lysine exporter protein LysE/YggA  25.95 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.332497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  30.34 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  32.26 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  32.8 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1213  transporter, LysE family  28.65 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.31 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3087  amino acid transporter LysE  27.78 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0525749  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  31.75 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  31.75 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  31.75 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  31.75 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  31.75 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  31.75 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  31.61 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  30.57 
 
 		 200 aa  72  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  30.57 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  30.57 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  29.31 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  31.64 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1462  LysE family transport protein  32.26 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0346145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10300  putative efflux protein  30.9 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0350881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  28.49 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  27.08 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.35 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 		 203 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  26.46 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  25.93 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  25.93 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3759  hypothetical protein  31.76 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.444425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  29.94 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  29.38 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  25.56 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  27.37 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  29.21 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  28.49 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.81 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  27.81 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  25.27 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  25.27 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  25.27 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1690  LysE family protein, putative  30.53 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0374  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.79 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3854  lysine exporter protein LysE/YggA  29.71 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  29.89 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  27.84 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2265  lysine exporter protein LysE/YggA  25.53 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499699  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2135  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2510  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  25.54 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5811  lysine exporter protein LysE/YggA  27 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6041  lysine exporter protein LysE/YggA  27 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  24.86 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  28.06 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  29.84 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2463  lysine exporter protein LysE/YggA  29.89 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.152581 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  28.21 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  25.71 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1471  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.55 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  27.96 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  32.58 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1022  homogentisate export protein  27.71 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000262161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  27.17 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>