More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1462 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1462  LysE family transport protein  100 
 
 		 218 aa  427  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0346145 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2135  lysine exporter protein LysE/YggA  39.87 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  31.9 
 
 		 199 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 202 aa  92.4  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0822  lysine exporter protein LysE/YggA  37.24 
 
 		 197 aa  88.6  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  28.65 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  36.43 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  36.15 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  28.19 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  30.32 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.94 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  30.86 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  30.77 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  31.52 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  31.41 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  28.8 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  36.57 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  30.89 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  34.84 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.9 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  29.69 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  30.89 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  30.89 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.87 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  30.37 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  33.13 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  34.96 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  33.59 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  27.81 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  28.34 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  32.41 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  30.82 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  31.46 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  33.59 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4757  lysine exporter protein LysE/YggA  34.55 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852741  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  37.9 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3854  lysine exporter protein LysE/YggA  31.97 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  41.03 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  37.9 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.57 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  37.9 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  29.26 
 
 		 197 aa  72  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  30.19 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  34.15 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  34.15 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  34.15 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  35.38 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  34.15 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  34.15 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1055  hypothetical protein  30.22 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0313  hypothetical protein  33.74 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0254408  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1658  hypothetical protein  33.74 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10300  putative efflux protein  32.72 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0350881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  30.19 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  34.15 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0280  hypothetical protein  32.26 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0885  amino acid transporter LysE  32.26 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2583  amino acid transporter LysE  32.26 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515909  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2447  hypothetical protein  32.26 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1461  hypothetical protein  32.26 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  30.82 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  30.83 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.03 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  34.81 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.94 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  29.93 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  34.81 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3759  hypothetical protein  31.97 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.444425  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0017  lysine exporter protein LysE/YggA  30.52 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0934766  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0374  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.68 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  30.25 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.08 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  37.1 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  37.1 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  33.52 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  33.87 
 
 		 640 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.03 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.87 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0272  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.53 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2526  lysine exporter protein LysE/YggA  32.81 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.332497  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4317  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381114  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  27.12 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  32.2 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3087  amino acid transporter LysE  23.68 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0525749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  29.37 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  30.66 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.37 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0577  hypothetical protein  33.6 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>