More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7782 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7782  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 202 aa  403  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.73 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  29.38 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  26.34 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  29.35 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5050  lysine exporter protein LysE/YggA  26.47 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.637848 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  25.81 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.94 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  29.59 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.97 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  30.97 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  30.97 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  28.05 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  26.29 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  27.84 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  26.79 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3086  lysine exporter protein LysE/YggA  26.79 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4987  lysine exporter protein LysE/YggA  26.79 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  32.69 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.17 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2393  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3439  lysine exporter protein LysE/YggA  26.23 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.783726 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.61 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  25 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  29.05 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  29.05 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.05 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.05 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  29.05 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.05 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.05 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.05 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.49 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  29.48 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.8 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  24.34 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  30.14 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0369  lysine exporter protein LysE/YggA  25.88 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.34 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  25.68 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  25.77 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.72 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  26.83 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  21.51 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  27.82 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  24.74 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  26.5 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  26.9 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  28.81 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  25 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0971  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.86 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  25.26 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  25.26 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.78 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2721  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.17 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0286436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  25.26 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  25.26 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  25.26 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  27.41 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  27.32 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4774  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.56 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0100683  hitchhiker  0.00129257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.42 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  25.25 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0849  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.12 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  26.18 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2992  lysine exporter protein LysE/YggA  24.71 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  27.41 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  28.67 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  28.86 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  26.9 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4641  lysine exporter protein LysE/YggA  25.44 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  25.96 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  25.6 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.94 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  23.27 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.49 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  26.9 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  26.9 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  32.73 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  24.19 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  29.25 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.65 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.49 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0969  putative threonine efflux protein  26.01 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00708139  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  27.14 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  26.59 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5170  lysine exporter protein LysE/YggA  25.44 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  27.37 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  26.32 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14510  putative threonine efflux protein  29.86 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.93793  normal  0.0749541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  26.6 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>