More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2698 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2698  putative threonine efflux protein  100 
 
 
208 aa  387  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.575587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0980  hypothetical protein  39.38 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00272416  normal  0.0487785 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  39.41 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  39.52 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2641  hypothetical protein  34.3 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.774137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  28.36 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.67 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  28.8 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.18 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  34.64 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  29.5 
 
 
206 aa  71.2  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  27.89 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  33.52 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.84 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  28.25 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  33.13 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  30.4 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  33.09 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.95 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  29.58 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  32.65 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  32.82 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.41 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  26.6 
 
 
211 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 
205 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  31.11 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  28.82 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  32.06 
 
 
212 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  32.82 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 
224 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  32.06 
 
 
212 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  32.82 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1324  leucine export protein LeuE  35.71 
 
 
222 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  28.57 
 
 
223 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 
208 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 
203 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  27.37 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.16 
 
 
205 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.82 
 
 
212 aa  62  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  32.82 
 
 
212 aa  62  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  34.07 
 
 
203 aa  62  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  30.37 
 
 
216 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  32.82 
 
 
212 aa  62  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2176  leucine export protein LeuE  31.85 
 
 
227 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  32.09 
 
 
211 aa  61.2  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  26.11 
 
 
208 aa  61.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  30.37 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  30.47 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  30.2 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1504  RhtB family transporter  34.96 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.672768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  31.21 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  31.13 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  27.78 
 
 
231 aa  58.9  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  27.97 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  29 
 
 
206 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  29.45 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  32.52 
 
 
203 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  32.52 
 
 
203 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  32.52 
 
 
203 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  30.77 
 
 
211 aa  58.5  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  32.52 
 
 
203 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  32.79 
 
 
203 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 
205 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  32.79 
 
 
217 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  26.73 
 
 
208 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.73 
 
 
208 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  28.03 
 
 
210 aa  58.2  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.4 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.66 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  24.76 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  25.96 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  28.16 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  32.79 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  29.73 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.88 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  34.71 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  27.75 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  29.69 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  27.75 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  27.75 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  27.75 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  29.69 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  27.75 
 
 
210 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  28.26 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  29.69 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.03 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  27.75 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  29.69 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.87 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  24.88 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>