More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2641 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2641  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  401  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.774137 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.47 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.2 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  33.16 
 
 		 205 aa  94.7  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2698  putative threonine efflux protein  34.3 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.575587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.64 
 
 		 242 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0980  hypothetical protein  33.5 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00272416  normal  0.0487785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.3 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  27.51 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  34.03 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  30.53 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  28.91 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  28.92 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  35.17 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.19 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  28.77 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  28.33 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  30.05 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  32.59 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0441  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.26 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  30.05 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  30.1 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  26.84 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  28.92 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  30.05 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  30.05 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.63 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.41 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  29.8 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  29.44 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  26.09 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2289  lysine exporter protein LysE/YggA  27.51 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.32 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  31.2 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  27.54 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  29.06 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  25.38 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  29.53 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  30.3 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  27.46 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  27.96 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.28 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  26.06 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  29.1 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  30.36 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  27.89 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  23.78 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  29.32 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  27.36 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.73 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.71 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  28 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  28.43 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  31.89 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  25.26 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2570  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00200022  unclonable  0.0000000406824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  27.4 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  30.3 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  29.92 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.55 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.32 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  28 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  27.86 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  25.91 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  29.92 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  27.36 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  27.36 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  27.36 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  27.36 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  32.94 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1504  RhtB family transporter  31.15 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  29.92 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  29.92 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.53 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  31.97 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  29.55 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  24.77 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  27.66 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.9 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  29.13 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  28.36 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  29.77 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  31.36 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  25.91 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  31.36 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>