More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0980 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0980  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  391  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00272416  normal  0.0487785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2698  putative threonine efflux protein  41.32 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.575587  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  38.51 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.54 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  30.37 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  29.35 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2641  hypothetical protein  33.5 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.774137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  29.94 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  26.57 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  29.25 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  34.06 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  26.53 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.48 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.21 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  29.45 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  28.67 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.94 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  32.82 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  31.25 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  31.25 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  29.66 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  29.07 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  31.25 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  31.25 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  31.85 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  30.47 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.92 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  28.87 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  30.47 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  30.47 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  29.25 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  31.11 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.7 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  26.7 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  32.31 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  28.93 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  25.81 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.8 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  25.81 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  25.81 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  25.81 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  29.73 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  28.47 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.14 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  28.35 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  25.14 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  30.71 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  26.4 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.8 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  28.28 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  24.02 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.17 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  27.21 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.03 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.37 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.87 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  29.87 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  27.71 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  29.87 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  27.46 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.88 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  27.66 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  28.31 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  25.17 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  27.71 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  30.08 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  24.6 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  30.08 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  26.2 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.29 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  28.46 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  30.08 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  30.08 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0969  putative threonine efflux protein  25 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00708139  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  23.22 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  31.54 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.14 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  30.77 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  25.93 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  28.46 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.35 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  27.27 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.55 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  28.42 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.76 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.28 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  29.37 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  25.18 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.483142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>