56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1436 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
208 aa  395  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.26 
 
 
208 aa  194  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  47.29 
 
 
209 aa  191  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  53.77 
 
 
227 aa  189  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  49.51 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  47.12 
 
 
218 aa  177  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 
215 aa  125  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  31.8 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  36.54 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.24 
 
 
214 aa  107  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 
217 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  31.41 
 
 
207 aa  98.2  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  32.11 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  30.89 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  32.74 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  31.25 
 
 
246 aa  89.4  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.95 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.66 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.37 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.93 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.42 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  28.22 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  20.79 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  29.3 
 
 
219 aa  61.2  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  26.57 
 
 
204 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  25.13 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  26.46 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  24.62 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  24.62 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  26.29 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2660  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.71 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000253226  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0208  lysine exporter protein LysE/YggA  24.62 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.22 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.39 
 
 
186 aa  48.5  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0221  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25 
 
 
202 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  24.75 
 
 
220 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  28.08 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0232  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.5 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 
211 aa  45.1  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 
189 aa  45.1  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  24.61 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  27.09 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.55 
 
 
226 aa  42.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  24.58 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  24.58 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  25.76 
 
 
211 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  23.08 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  26.73 
 
 
210 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 
233 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  25.25 
 
 
210 aa  42  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  26.88 
 
 
210 aa  41.6  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  25.76 
 
 
210 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  27.23 
 
 
247 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>