46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1430 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 207 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.57 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.48 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  37.36 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3067  lysine exporter protein LysE/YggA  38.1 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000755929  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0232  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.65 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0221  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.17 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1053  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.76 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2660  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.1 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000253226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0224  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0208  lysine exporter protein LysE/YggA  34.03 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3867  lysine exporter protein LysE/YggA  31.33 
 
 		 203 aa  84.7  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  23.04 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  24.88 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  25 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  25.89 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  23.04 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  29.23 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.54 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  26.32 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  21.64 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.35 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  29.75 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  23.53 
 
 		 215 aa  45.1  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.56 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  28.74 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.55 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  28.74 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  30.15 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  26.04 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  20.47 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  28.74 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.63 
 
 		 208 aa  42  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  28.89 
 
 		 225 aa  41.6  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  20.9 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  26.63 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  28.74 
 
 		 224 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  28.74 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  28.74 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  28.74 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  20.9 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  20.9 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>