41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0217 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
222 aa  415  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  54.59 
 
 
225 aa  206  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  49.77 
 
 
219 aa  178  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.41 
 
 
214 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 
217 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  39.35 
 
 
229 aa  129  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  39.11 
 
 
246 aa  128  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  42.99 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.49 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.15 
 
 
273 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  37.96 
 
 
227 aa  97.4  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.15 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 
205 aa  96.3  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  32.84 
 
 
218 aa  89  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 
208 aa  88.2  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  29.81 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  28.08 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  30.58 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  30.1 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  28.71 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  29.29 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  29.83 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.42 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2697  lysine exporter protein LysE/YggA  27.7 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  26.32 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  24.86 
 
 
206 aa  47  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  28.79 
 
 
204 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.78 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  29.13 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  32.56 
 
 
216 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  26.35 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 
204 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  26.09 
 
 
204 aa  41.6  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 
204 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 
204 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>