44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1638 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
227 aa  449  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  54.46 
 
 
209 aa  230  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.55 
 
 
208 aa  215  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  53.77 
 
 
208 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  47.14 
 
 
218 aa  201  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  46.5 
 
 
205 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  38.35 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  34.63 
 
 
217 aa  118  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 
219 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 
229 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.31 
 
 
214 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  32.73 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  28.99 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.43 
 
 
222 aa  92.4  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  29.38 
 
 
206 aa  92  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  29.38 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  28.33 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  35.42 
 
 
200 aa  88.6  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  28.06 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  28.19 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.35 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.74 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  21.89 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  27.67 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  27.49 
 
 
204 aa  62.8  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  26.46 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  29.47 
 
 
219 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.87 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.63 
 
 
205 aa  55.1  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.53 
 
 
205 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  24.02 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  24.02 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  25.26 
 
 
209 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  24.46 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.79 
 
 
226 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  23.41 
 
 
222 aa  45.4  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.35 
 
 
186 aa  45.1  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  25.35 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  23.87 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  28.37 
 
 
215 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  26.72 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  27.34 
 
 
218 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.24 
 
 
226 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>