31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2082 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  100 
 
 		 246 aa  475  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.59 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  44.26 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  43.67 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.96 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.83 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  31.85 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  29.71 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  31.67 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  30.38 
 
 		 209 aa  105  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.71 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  31.33 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.79 
 
 		 209 aa  98.6  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 		 200 aa  96.3  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  26.07 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  28.09 
 
 		 191 aa  72  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  26.07 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  24.59 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  26.32 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  27.67 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.48 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.55 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  22.94 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  31.41 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  23.5 
 
 		 229 aa  45.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.2 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  21.25 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  31.01 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>