77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0570 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 200 aa  384  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.39 
 
 		 209 aa  143  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  36.53 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  36.79 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.26 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.52 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  35.5 
 
 		 217 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.66 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  32.16 
 
 		 218 aa  94.7  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  34.9 
 
 		 227 aa  88.6  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  29.7 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  29.7 
 
 		 207 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  29.21 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  30.5 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  31.25 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  30.21 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.96 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  28.98 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  28.43 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  25.64 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3094  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  26.34 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  26.34 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.11 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  27.38 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  27.38 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  27.38 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  26.79 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3935  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  27.88 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  26.79 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0239  amino acid transporter LysE  28.48 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  25.25 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0974  lysine exporter protein LysE/YggA  26.47 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.253527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  25.74 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  25.74 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  24.75 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  26.95 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  26.32 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  23.33 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  23.33 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  24.84 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  26.42 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  28.1 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0687  amino acid transporter LysE  28.15 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  28.31 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  24.39 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2930  lysine exporter protein LysE/YggA  25.64 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000123984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.39 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  26.6 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  29.08 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.09 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1193  amino acid transporter LysE  28.15 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.728705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.38 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  22.93 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  25 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1070  amino acid transporter LysE  28.15 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272013  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0626  amino acid transporter LysE  24.14 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.38737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.42 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1138  lysine exporter protein LysE/YggA  26.09 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  25.25 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.86 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3087  amino acid transporter LysE  27.5 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0525749  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1266  homogentisate export protein  34.45 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.733193  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  28.36 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1363  LysE family translocator protein  28.69 
 
 		 195 aa  42  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00372502  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  26.42 
 
 		 211 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  22.12 
 
 		 210 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0221  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.64 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  26.42 
 
 		 211 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>