68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3051 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 205 aa  390  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  96.1 
 
 		 205 aa  355  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  41.58 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.81 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3067  lysine exporter protein LysE/YggA  43.01 
 
 		 198 aa  121  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000755929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2660  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.9 
 
 		 191 aa  101  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000253226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0221  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.67 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0232  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.16 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3867  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0208  lysine exporter protein LysE/YggA  33.1 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  28.21 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1053  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.62 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  26.19 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  28 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  28.93 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  26.96 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0224  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.96 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0550484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  25.39 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  23.71 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  25 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.24 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3860  lysine exporter protein LysE/YggA  30.7 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000283394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  24.87 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  24.15 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4501  lysine exporter protein (LysE/YggA)  32.76 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135665 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  26.77 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  26.77 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  26.77 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  26.77 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  26.77 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4912  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.15938 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.08 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  28.91 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  29.58 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  25.37 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  25.37 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  25.37 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  25.37 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  25.37 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  25.37 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0850  lysine exporter protein LysE/YggA  29.2 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0203758  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  28.02 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  25.37 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  24.88 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4254  lysine exporter protein LysE/YggA  26.89 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  24.88 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.83 
 
 		 239 aa  45.4  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1186  putative lysine exporter protein  27.19 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1426  LysE family protein  29.77 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  27.94 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  32.35 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.37 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3118  lysine exporter protein LysE/YggA  28.45 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1663  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3139  LysE family translocator protein  29.63 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3176  LysE family translocator protein  29.63 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0237  hypothetical protein  26.32 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0893  LysE family protein  29.63 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2726  LysE family protein  29.63 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726178  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2021  LysE family protein  29.63 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1883  LysE family protein  29.63 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496425  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  25.81 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>