54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0680 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 217 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.62 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  40.74 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  41.75 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  39.15 
 
 		 225 aa  145  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  36.36 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.98 
 
 		 273 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  36.71 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  36.89 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.71 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  35.5 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  34.17 
 
 		 246 aa  101  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  28.3 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  30.29 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  29.06 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  26.22 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  23.63 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  24.39 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  23.38 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  25 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  23.38 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  27.33 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  23.38 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  23.38 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  28.42 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1193  amino acid transporter LysE  24.86 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.728705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  23.38 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  23.38 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0391  lysine exporter protein LysE/YggA  25.84 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0687  amino acid transporter LysE  24.31 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  24.63 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0626  amino acid transporter LysE  25.82 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.38737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  24.39 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  24.85 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.86 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  27.08 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.76 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  20 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1070  amino acid transporter LysE  25.95 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272013  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  20.69 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.32 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  27.91 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  19.8 
 
 		 212 aa  42  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  19.8 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  23.26 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  19.8 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>