36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0329 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  100 
 
 		 206 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  97.09 
 
 		 207 aa  378  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  92.23 
 
 		 207 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  36.89 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  30.37 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  29.74 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  33.84 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 206 aa  91.3  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.16 
 
 		 208 aa  85.9  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  30.57 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  31.02 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.58 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  29.21 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  30.29 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  27.46 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  26.99 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.58 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  29.15 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.26 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  28.42 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  26.35 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  30.32 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.26 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  28.22 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1138  lysine exporter protein LysE/YggA  27.13 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  30.93 
 
 		 246 aa  52.4  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  23.28 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.28 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.25 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1193  amino acid transporter LysE  25.41 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.728705  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.2 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0687  amino acid transporter LysE  23.89 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.32 
 
 		 227 aa  41.6  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1070  amino acid transporter LysE  25.41 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>