27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1858 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
204 aa  393  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  86.46 
 
 
204 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  68.47 
 
 
206 aa  259  2e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  42.11 
 
 
219 aa  127  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  28 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  28.64 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  29.15 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  27.89 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  28.37 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  28.19 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.51 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  26.7 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.44 
 
 
209 aa  62  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  27 
 
 
205 aa  61.6  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  26.57 
 
 
208 aa  58.9  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.88 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  24.39 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  25.77 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0391  lysine exporter protein LysE/YggA  31.62 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.5 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.16 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.29 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>