44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0309 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 207 aa  407  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  92.23 
 
 		 206 aa  367  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  92.27 
 
 		 207 aa  367  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  31.41 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  33.98 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.7 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  31.48 
 
 		 225 aa  85.9  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.52 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  30.33 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 		 215 aa  84.7  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  29.7 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  30.14 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  29.2 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.61 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.64 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  29.26 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  26.95 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  29.06 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1138  lysine exporter protein LysE/YggA  27.66 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  20.33 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.28 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  28.87 
 
 		 246 aa  52.4  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  23.2 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.46 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.46 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1193  amino acid transporter LysE  24.86 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.728705  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0687  amino acid transporter LysE  23.33 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1070  amino acid transporter LysE  24.86 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272013  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.2 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  23.63 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  24.04 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  26.11 
 
 		 208 aa  42  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  24.74 
 
 		 222 aa  42  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  23.94 
 
 		 233 aa  41.6  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  24.04 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  24.04 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  24.04 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  24.04 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>