37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_271 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  100 
 
 		 207 aa  408  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  97.09 
 
 		 206 aa  377  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  92.27 
 
 		 207 aa  367  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  30.89 
 
 		 208 aa  104  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  33.84 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.69 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 215 aa  84.7  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  31.48 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.58 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  29.7 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  29.86 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  27.46 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  27.88 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.1 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  28.64 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.26 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  26.35 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  28.22 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.26 
 
 		 273 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1138  lysine exporter protein LysE/YggA  26.6 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  24.46 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  30.93 
 
 		 246 aa  52  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  23.28 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.17 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1053  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.59 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1193  amino acid transporter LysE  24.86 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.728705  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0687  amino acid transporter LysE  23.33 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  22.96 
 
 		 233 aa  41.2  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1070  amino acid transporter LysE  24.86 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>