25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2018 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 206 aa  389  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  68.47 
 
 		 204 aa  267  7e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  75.13 
 
 		 204 aa  263  2e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  48.08 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  28.14 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  28.93 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  27.8 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  26.92 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  26.29 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  26.26 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  26.94 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  27.7 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.53 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  23.23 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.72 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  25.24 
 
 		 229 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.06 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  28 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  24.61 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  28.87 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  26.5 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  29.94 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  29.9 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>