48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1393 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  427  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  50.24 
 
 		 205 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  44.29 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  44.44 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  45.71 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.67 
 
 		 208 aa  177  7e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  47.12 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  34 
 
 		 219 aa  117  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  34.86 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  33.98 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  32.14 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  32.14 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.03 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  27.67 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  27.36 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  25.82 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  28.19 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  36.84 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.09 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.7 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.87 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.08 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  25.93 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  30.23 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.73 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  27.48 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  24.32 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  24.32 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  24.32 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  28 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.08 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.91 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  22.55 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1754  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.95 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  22.73 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  23.74 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  23.74 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0221  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.23 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  23.74 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  27.09 
 
 		 189 aa  42.4  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  23.23 
 
 		 208 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  21.72 
 
 		 220 aa  42  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>