20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1754 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1754  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 213 aa  413  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.08 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  26.63 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1015  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.486476  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3368  lysine exporter protein LysE/YggA  26.81 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0288  lysine exporter protein LysE/YggA  29.03 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  27.1 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  25.58 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  30.91 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  27.11 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  29.82 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  24.81 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  30.91 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  30.91 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  30.36 
 
 		 215 aa  42  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  30 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  30 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  30 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  30 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  27.61 
 
 		 223 aa  41.6  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>