34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1015 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1015  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
225 aa  440  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.486476  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03425  hypothetical protein  50 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0833  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.68 
 
 
221 aa  211  5.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.54 
 
 
213 aa  95.9  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0550484  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0991  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.75 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0472  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.42 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.464761  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1663  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.53 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.74 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  26.4 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  26.4 
 
 
208 aa  52  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  26.4 
 
 
208 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  25.89 
 
 
208 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  24.29 
 
 
215 aa  51.6  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.92 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  27.21 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  29.5 
 
 
208 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  29.5 
 
 
208 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0626  amino acid transporter LysE  23.57 
 
 
200 aa  47  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.38737  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  28.23 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  26.85 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0239  amino acid transporter LysE  25.42 
 
 
199 aa  45.8  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1754  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 
213 aa  45.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  26.61 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  25.45 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0858  lysine exporter protein LysE/YggA  26.67 
 
 
211 aa  45.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.74992  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  27.52 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  22.87 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.81 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  25.45 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.09 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  26.19 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  26.18 
 
 
209 aa  41.6  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  22.69 
 
 
210 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  21.4 
 
 
207 aa  41.6  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>