23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03425 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03425  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  448  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0833  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.34 
 
 
221 aa  234  9e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1015  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 
225 aa  230  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.486476  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.9 
 
 
213 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0550484  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0991  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.73 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0239  amino acid transporter LysE  28.27 
 
 
199 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0472  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.63 
 
 
204 aa  55.1  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.464761  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1663  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.74 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0687  amino acid transporter LysE  29.85 
 
 
199 aa  49.3  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  27.59 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1193  amino acid transporter LysE  29.63 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.728705  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.42 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1070  amino acid transporter LysE  29.85 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  27.09 
 
 
208 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  26.6 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  26.6 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  25.15 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  26.6 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  26.6 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  24.56 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.43 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  23.67 
 
 
212 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  23.67 
 
 
212 aa  41.6  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>