32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1663 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1663  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 212 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0472  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.35 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.464761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.29 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0550484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0991  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.89 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1015  lysine exporter protein LysE/YggA  23.53 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.486476  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  30.35 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  21.84 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  22.33 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  21.84 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  21.84 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  21.84 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  21.36 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  20.81 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  21.36 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  21.36 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10300  putative efflux protein  26.29 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0350881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  20.87 
 
 		 233 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03425  hypothetical protein  24.21 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  27.59 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.37 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  25.91 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  35.56 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.78 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  27.53 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  22.11 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  30.08 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  25.71 
 
 		 212 aa  42  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  23.78 
 
 		 215 aa  42  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  31.82 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>