67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1225 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 205 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  96.1 
 
 		 205 aa  355  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  39.02 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.72 
 
 		 207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3067  lysine exporter protein LysE/YggA  43.55 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000755929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2660  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.12 
 
 		 191 aa  98.2  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000253226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0221  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.07 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0232  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.31 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3867  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0208  lysine exporter protein LysE/YggA  31.13 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1053  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.62 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  27.69 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  25.24 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  27.75 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0224  lysine exporter protein LysE/YggA  31.48 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  24.23 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  26.6 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.96 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0550484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  26.11 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  25.12 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3860  lysine exporter protein LysE/YggA  30.7 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000283394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  24.37 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4501  lysine exporter protein (LysE/YggA)  32.76 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  26.34 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.19 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  26.34 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4912  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.15938 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  26.34 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  26.34 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  26.34 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  29.12 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  28.57 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.24 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  28.47 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  30.95 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  25.85 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0850  lysine exporter protein LysE/YggA  28.32 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0203758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  23.19 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  27.74 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  25.85 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  25.85 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  25.85 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4254  lysine exporter protein LysE/YggA  26.89 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  25.85 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  25.85 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  25.37 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  25.37 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.5 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1426  LysE family protein  30.71 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  29.5 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  26.67 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3118  lysine exporter protein LysE/YggA  28.45 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1186  putative lysine exporter protein  26.32 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.71 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  31.11 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0893  LysE family protein  30.56 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2726  LysE family protein  30.56 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726178  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3139  LysE family translocator protein  30.56 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3176  LysE family translocator protein  30.56 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1883  LysE family protein  30.56 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496425  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2021  LysE family protein  30.56 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1663  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.78 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0237  hypothetical protein  26.32 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  27.18 
 
 		 210 aa  41.6  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  26.61 
 
 		 219 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>