34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0208 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0208  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
202 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0221  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  96.04 
 
 
202 aa  356  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0232  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  95.54 
 
 
202 aa  352  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0224  lysine exporter protein LysE/YggA  69.65 
 
 
205 aa  227  9e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1053  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.78 
 
 
200 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3867  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
203 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556389  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.57 
 
 
207 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  25.76 
 
 
209 aa  87.8  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.12 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.33 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3067  lysine exporter protein LysE/YggA  33.56 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000755929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2660  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.48 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000253226  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  26 
 
 
208 aa  51.6  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  30.52 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.75 
 
 
239 aa  49.7  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  26.94 
 
 
189 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  27.64 
 
 
202 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.53 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.82 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  27.98 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.75 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.26 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  24.23 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  26 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  28.57 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  29.14 
 
 
210 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  37.01 
 
 
221 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.6 
 
 
226 aa  41.6  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  21.78 
 
 
208 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  21.78 
 
 
208 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.89 
 
 
209 aa  41.2  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.37 
 
 
217 aa  41.2  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  31.3 
 
 
197 aa  41.2  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>