32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0232 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0232  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 202 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0221  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  96.53 
 
 		 202 aa  357  6e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0208  lysine exporter protein LysE/YggA  95.54 
 
 		 202 aa  327  9e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0224  lysine exporter protein LysE/YggA  69.5 
 
 		 205 aa  225  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1053  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.88 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3867  lysine exporter protein LysE/YggA  38.27 
 
 		 203 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.17 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  26.77 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.12 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.87 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2660  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.57 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000253226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3067  lysine exporter protein LysE/YggA  32.89 
 
 		 198 aa  72  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000755929  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  28.06 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.51 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  24.5 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  28.45 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.81 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.65 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  32.17 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  27.96 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.33 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1467  lysine exporter protein LysE/YggA  32.64 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  29.31 
 
 		 210 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4133  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 210 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4264  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 210 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  35.63 
 
 		 237 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  29.31 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  35.63 
 
 		 237 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  35.63 
 
 		 240 aa  41.2  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>