45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3867 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3867  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556389  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1053  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.61 
 
 
200 aa  154  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0208  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0221  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.49 
 
 
202 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0232  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.46 
 
 
202 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0224  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.33 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.15 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3067  lysine exporter protein LysE/YggA  33.56 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000755929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.32 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2660  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.12 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000253226  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  26.63 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.17 
 
 
239 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.61 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  26.42 
 
 
189 aa  52  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.25 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06278  putative threonine efflux protein  37.66 
 
 
210 aa  48.1  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001442  threonine efflux protein  29.17 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  30.17 
 
 
220 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  25.81 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0237  hypothetical protein  31.36 
 
 
209 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.98 
 
 
186 aa  45.1  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  27.33 
 
 
201 aa  45.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.78 
 
 
226 aa  45.1  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  30.25 
 
 
224 aa  44.7  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  30.25 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.19 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1186  putative lysine exporter protein  30.33 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4166  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  0.273019 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  27.01 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  28.57 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4254  lysine exporter protein LysE/YggA  31.2 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  26.99 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  25.89 
 
 
208 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1471  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.22 
 
 
195 aa  42.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  27.74 
 
 
199 aa  42.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0626  amino acid transporter LysE  24.59 
 
 
200 aa  42  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.38737  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  31.97 
 
 
210 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  28.31 
 
 
209 aa  42  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  31.01 
 
 
207 aa  41.6  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1018  lysine exporter protein  28.81 
 
 
218 aa  42  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  0.285378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4501  lysine exporter protein (LysE/YggA)  31.2 
 
 
214 aa  41.6  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0850  lysine exporter protein LysE/YggA  29.84 
 
 
211 aa  41.6  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0203758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  26.09 
 
 
205 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  32.86 
 
 
205 aa  41.2  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>