38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0224 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0224  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
205 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0221  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  69.15 
 
 
202 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0232  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  69.5 
 
 
202 aa  245  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0208  lysine exporter protein LysE/YggA  69.65 
 
 
202 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1053  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.88 
 
 
200 aa  144  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3867  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556389  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.07 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  25.13 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2660  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.16 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000253226  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3067  lysine exporter protein LysE/YggA  32.26 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000755929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.68 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.68 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  27.86 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0441  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.37 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  24.87 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.81 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.38 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.96 
 
 
186 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.82 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.62 
 
 
239 aa  46.6  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.1 
 
 
214 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  33.59 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  23.59 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  31.45 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  22.33 
 
 
218 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  23.68 
 
 
205 aa  42.4  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  27.75 
 
 
205 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  32.35 
 
 
224 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  30.4 
 
 
199 aa  42  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.85 
 
 
209 aa  41.6  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  31.15 
 
 
202 aa  41.6  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  32.35 
 
 
217 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  32.35 
 
 
217 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  32.35 
 
 
217 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
200 aa  41.2  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  29.46 
 
 
214 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 
203 aa  41.6  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  29.58 
 
 
225 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>