96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3244 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  100 
 
 
209 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.68 
 
 
205 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.68 
 
 
205 aa  158  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.36 
 
 
207 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3067  lysine exporter protein LysE/YggA  37.72 
 
 
198 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000755929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2660  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.74 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000253226  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0232  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.77 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0221  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.26 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0208  lysine exporter protein LysE/YggA  25.76 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  24.38 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0224  lysine exporter protein LysE/YggA  24.62 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  25.82 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  20.79 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  21.72 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.46 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1053  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.45 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3867  lysine exporter protein LysE/YggA  26.63 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556389  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  25.27 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  22.28 
 
 
227 aa  58.9  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  24.2 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  29.23 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  29.23 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  29.23 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  29.23 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  29.23 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  20.33 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  28.72 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  25.56 
 
 
208 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  20.33 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  25.64 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  26.76 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  26.42 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  26.76 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  20.22 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  26.76 
 
 
210 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  26.76 
 
 
210 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  26.53 
 
 
205 aa  48.5  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  26.76 
 
 
233 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.16 
 
 
208 aa  48.5  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  29 
 
 
203 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  24.59 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  26.06 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  29 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  26.06 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  26.06 
 
 
247 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  26.06 
 
 
247 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  23.76 
 
 
191 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  27.65 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  25.17 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  26.59 
 
 
210 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  26.59 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  24.57 
 
 
219 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.13 
 
 
239 aa  46.2  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  24.57 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  26.13 
 
 
205 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  27.05 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  23.94 
 
 
210 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  26.59 
 
 
210 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  26.59 
 
 
210 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  27.27 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  26.67 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  26.4 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.59 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  27.27 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  26.89 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.4 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  23.01 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  29.73 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  28.18 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  25.17 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  25.93 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  26.78 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  25.52 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  27.86 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  25.93 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  25 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  28.18 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  29.41 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  27.42 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  27.91 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  26.95 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1138  hypothetical protein  26.4 
 
 
203 aa  42.4  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  27.12 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  24.54 
 
 
225 aa  42  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.56 
 
 
235 aa  42  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  30.43 
 
 
205 aa  42  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0858  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 
211 aa  42  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.74992  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  28.47 
 
 
210 aa  42  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  25.76 
 
 
212 aa  41.6  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  27.13 
 
 
204 aa  41.6  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  25.76 
 
 
212 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  25.76 
 
 
209 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>