33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0646 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 206 aa  401  1e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  28 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  31.89 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  27.18 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  29.9 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  29.9 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  29.7 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.53 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  27.64 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  28.28 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  29.06 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  28.23 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  27.36 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  25.47 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.47 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.33 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  29.22 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.37 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  25.27 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  26.42 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  23.79 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  29.69 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.81 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.09 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.02 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  30.68 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0626  amino acid transporter LysE  24.47 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.38737  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2930  lysine exporter protein LysE/YggA  26.98 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000123984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.89 
 
 		 213 aa  42  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0550484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  23.73 
 
 		 220 aa  41.6  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>