29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1264 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
204 aa  381  1e-105  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  86.21 
 
 
204 aa  343  1e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  73.37 
 
 
206 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  45.93 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 
206 aa  106  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  26.77 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.45 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  27.94 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  26.26 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  25.85 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  26.26 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.87 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  26.73 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  27.13 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  25.96 
 
 
229 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  26.26 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  22.33 
 
 
217 aa  54.7  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  23.91 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.14 
 
 
205 aa  52  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.71 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  25.26 
 
 
219 aa  48.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.23 
 
 
214 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  28 
 
 
246 aa  44.7  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.72 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0391  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  24.59 
 
 
209 aa  41.2  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>