225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0656 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
235 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  60.34 
 
 
239 aa  249  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  61.86 
 
 
226 aa  244  8e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.55 
 
 
226 aa  236  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.64 
 
 
217 aa  223  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.58 
 
 
186 aa  97.8  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
189 aa  88.6  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0391  lysine exporter protein LysE/YggA  33.47 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1138  lysine exporter protein LysE/YggA  29.67 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  24.43 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  24.89 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  24.77 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  32.17 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  32.17 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  31.75 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  31.75 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  31.75 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  31.75 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  31.75 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  31.75 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.84 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  22.22 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  23.64 
 
 
210 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  32.82 
 
 
225 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 
210 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 
212 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  23.64 
 
 
211 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  30.14 
 
 
212 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  23.64 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  21.76 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  27.41 
 
 
208 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  22.22 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  31.39 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  21.76 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  21.76 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  33.61 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  21.76 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  23.64 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  31.67 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  31.67 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  31.67 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  31.39 
 
 
219 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  31.67 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  31.39 
 
 
219 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  31.39 
 
 
219 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0239  amino acid transporter LysE  26.24 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
206 aa  58.5  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  34.06 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  31.21 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0626  amino acid transporter LysE  26.64 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.38737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  31.01 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  28.37 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  22.62 
 
 
229 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1371  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 
206 aa  55.8  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  29.69 
 
 
220 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  34.07 
 
 
197 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  27.91 
 
 
197 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  38.2 
 
 
207 aa  55.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  29.93 
 
 
219 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  27.34 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  28.1 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  26.61 
 
 
212 aa  53.5  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  30.65 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  28.27 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  28.1 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0237  hypothetical protein  37.29 
 
 
209 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  28.1 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  28.1 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 
212 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  28.57 
 
 
212 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  28.57 
 
 
212 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  26.72 
 
 
222 aa  52  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2660  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000253226  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  27.27 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  26.56 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2176  leucine export protein LeuE  27.27 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  29.01 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  28.68 
 
 
201 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3295  lysine exporter protein LysE/YggA  28.91 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.83 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  28.23 
 
 
214 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1186  putative lysine exporter protein  33.9 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1180  leucine export protein LeuE  29.08 
 
 
223 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  33.06 
 
 
211 aa  49.3  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  28.29 
 
 
222 aa  49.3  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  32.71 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  29.27 
 
 
209 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  29.27 
 
 
209 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0221  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.9 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  25.56 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>