132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1383 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  100 
 
 
212 aa  414  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  29.53 
 
 
201 aa  95.5  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.35 
 
 
202 aa  95.1  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  26.96 
 
 
210 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  29.21 
 
 
210 aa  90.5  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  27.45 
 
 
210 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  27.45 
 
 
210 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6378  hypothetical protein  28.89 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266594  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  26.96 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  31.73 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.15 
 
 
207 aa  89  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  33.53 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  31.47 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  29.1 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2268  hypothetical protein  32.02 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  27.27 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  31.54 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  31.54 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  31.54 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  27.27 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  31.54 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0804  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.28 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  29.63 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0754  lysine exporter protein LysE/YggA  29.48 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.754673  normal  0.702985 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  28.41 
 
 
208 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.98 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2720  LysE/RhtB family amino acid efflux pump  28.14 
 
 
202 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1378  lysine exporter protein LysE/YggA  28.14 
 
 
202 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69101  normal  0.262549 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0239  amino acid transporter LysE  28.46 
 
 
199 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2137  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.03 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3675  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.04 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  23.61 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  27.54 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  26.16 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  22.92 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  21.95 
 
 
207 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  22.44 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  21.95 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  22.44 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.27 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04850  hypothetical protein  27.54 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.85439  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  27.13 
 
 
208 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  28.57 
 
 
209 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  28.57 
 
 
212 aa  48.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  28.57 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  23.66 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  25.13 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  26.4 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  24.5 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  26.32 
 
 
212 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.61 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  24.88 
 
 
205 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  23.66 
 
 
247 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  26.67 
 
 
215 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4097  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.57 
 
 
213 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  26.67 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  26.67 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.36 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  24.87 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  22.9 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  23.66 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  22.9 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  20.4 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  26.67 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  26.67 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  22.96 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 
214 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  24.76 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.39 
 
 
230 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852765  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.22 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  26 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  20.4 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  23.98 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  22.9 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.56 
 
 
239 aa  45.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  24.44 
 
 
208 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  23.7 
 
 
247 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  26.47 
 
 
205 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  22.9 
 
 
233 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  27.91 
 
 
197 aa  45.4  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  26 
 
 
210 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  26 
 
 
223 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  22.9 
 
 
210 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  27.42 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  24.86 
 
 
210 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  21.46 
 
 
207 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  27.27 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  19.9 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4486  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.2 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  24.74 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.86 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1754  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.1 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.71 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4824  lysine exporter protein LysE/YggA  26.11 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.322328  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  25.58 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>