207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3877 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  100 
 
 		 221 aa  427  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0804  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  91.86 
 
 		 213 aa  360  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  76.02 
 
 		 213 aa  315  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  71.95 
 
 		 205 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.81 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 		 220 aa  118  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.79 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  36.1 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  35.02 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  36.74 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  34.1 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  34.56 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  34.56 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  35.59 
 
 		 210 aa  102  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  34.56 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 		 212 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  39.52 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6378  hypothetical protein  37.78 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  38.65 
 
 		 197 aa  89  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2137  lysine exporter protein LysE/YggA  37.33 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0754  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.754673  normal  0.702985 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2268  hypothetical protein  31.71 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  29.63 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  28.7 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  27.91 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  30.07 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  30.07 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  30.07 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  25.81 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  28.76 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  28.76 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  29.44 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5087  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.12 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  28.89 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  28.36 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  28.1 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  28.64 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  28.64 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  28.64 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  27.44 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  27.86 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.98 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  24.29 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  27.04 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  26.98 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.98 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  25.62 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.22 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  27.17 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  27.86 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  24.42 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  29.22 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  27.85 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  26.4 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  23.32 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  28.36 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  28.48 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  28.48 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.62 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  27.45 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  28.43 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  24.07 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  26.67 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  25.93 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.93 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  28.19 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  26.15 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  27.94 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  26.8 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  26.42 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  28.05 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  26.54 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  26.15 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  26.15 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  26.54 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  24.12 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  25.51 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  25.35 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  26.15 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  26.05 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  25.31 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  26.05 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  26.05 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  26.05 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  24.69 
 
 		 247 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  26.05 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  26.05 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.61 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  22.07 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  25.93 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4482  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.82 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  22.07 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  25.39 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  25.58 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  25.58 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  25.39 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  24.87 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>