149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0754 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0754  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 213 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.754673  normal  0.702985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.28 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  40.41 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.95 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  38.83 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  39 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  35.86 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  37.23 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  38 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  39.11 
 
 		 197 aa  91.7  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0804  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.65 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  33.97 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2268  hypothetical protein  37.31 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2137  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  29.48 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2720  LysE/RhtB family amino acid efflux pump  42.49 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1378  lysine exporter protein LysE/YggA  42.49 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69101  normal  0.262549 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  26.47 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  26.47 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  25.98 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  25.98 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  27.46 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6378  hypothetical protein  30.05 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266594  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  25.98 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  25.98 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  24.86 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  24.86 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  27.32 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  24.86 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  24.86 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  24.86 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  24.86 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  24.86 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  24.32 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  24.32 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  23.5 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  27.15 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  27.23 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.06 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.06 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  22.44 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  24.74 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  21.84 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  21.84 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  26.19 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.19 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  28.8 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  28.8 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  28.8 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  28.8 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  28.8 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  26.19 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  28.8 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5675  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.16 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.920689  normal  0.0700576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  28.26 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.1 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  28.26 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  31.43 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  26.19 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  26.74 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  26.74 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  26.74 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  26.74 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  26.74 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  23.68 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  28.64 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  23.68 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.68 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  28.87 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  30.36 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.9 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  23.68 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.9 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0550484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  23.68 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  23.68 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  23.68 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  23.68 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  30.36 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  28.45 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  25.83 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  28.45 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  28.45 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.71 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  25.83 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  28.45 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  25.77 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  25.18 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  25.25 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  29.92 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  25.83 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>