204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4033 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
207 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.24 
 
 
202 aa  171  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.27 
 
 
207 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  45.55 
 
 
220 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  46.27 
 
 
223 aa  144  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  44.78 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  44.78 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  44.28 
 
 
210 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 
210 aa  135  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  46.27 
 
 
212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  44.06 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  46.27 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  41.71 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  51.3 
 
 
197 aa  127  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  40.76 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0754  lysine exporter protein LysE/YggA  39 
 
 
213 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.754673  normal  0.702985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0804  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.65 
 
 
213 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  36.74 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  33.53 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2137  lysine exporter protein LysE/YggA  46.67 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2268  hypothetical protein  38.34 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2720  LysE/RhtB family amino acid efflux pump  45.23 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1378  lysine exporter protein LysE/YggA  45.23 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69101  normal  0.262549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6378  hypothetical protein  38.55 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266594  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  26.37 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  26.37 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  25.87 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  25.87 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  25.87 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  25.87 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  29.88 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.84 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.94 
 
 
208 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  32.43 
 
 
242 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
226 aa  58.2  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0239  amino acid transporter LysE  29.03 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  33.87 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.8 
 
 
235 aa  55.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  32.19 
 
 
211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  32.19 
 
 
211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  32.19 
 
 
211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  32.19 
 
 
211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  27.27 
 
 
211 aa  55.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 
208 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.19 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  32.79 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  30.82 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  28.24 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.19 
 
 
209 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  32.19 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  32.19 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  23.96 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  34.15 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  23.44 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.23 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  32.14 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  25.38 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  32.14 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.08 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  23.44 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0626  amino acid transporter LysE  30.4 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.38737  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  28.86 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  24.62 
 
 
233 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  23.56 
 
 
229 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.8 
 
 
213 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  23.31 
 
 
215 aa  51.6  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  25.38 
 
 
247 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0289  RhtB family transporter  33.57 
 
 
209 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  24.62 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.65 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  25 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  25.66 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  33.05 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  25.38 
 
 
247 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  23.85 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  23.85 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  29.21 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  23.85 
 
 
233 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  29.21 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  23.31 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  29.21 
 
 
210 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  29.21 
 
 
210 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  29.21 
 
 
210 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  23.85 
 
 
210 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5087  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.16 
 
 
209 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  30.94 
 
 
207 aa  48.5  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  26.99 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.93 
 
 
186 aa  48.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  31.85 
 
 
203 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  29.27 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0687  amino acid transporter LysE  27.42 
 
 
199 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1070  amino acid transporter LysE  27.2 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>