72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2982 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  100 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  98.6 
 
 		 215 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  28.65 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0239  amino acid transporter LysE  34.51 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  28.88 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  28.49 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  28.11 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  28.11 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  28.11 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  28.11 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  28.11 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  28.11 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  27.72 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  33.8 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1193  amino acid transporter LysE  29.31 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.728705  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.41 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0550484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0626  amino acid transporter LysE  26.87 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.38737  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  22.92 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.19 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  28.37 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0687  amino acid transporter LysE  26.32 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  22.79 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  27.73 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  22.3 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  22.3 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  27.73 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  27.73 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  26.89 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  29.5 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  28.99 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1070  amino acid transporter LysE  26.43 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272013  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1015  lysine exporter protein LysE/YggA  27.21 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.486476  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0991  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.11 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  29.5 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  29.5 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  24.1 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.14 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  28.78 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  28.78 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  22.83 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  24.1 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  22.3 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  23.84 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  23.84 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  23.84 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  23.19 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  22.83 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  26.4 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  22.83 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  22.83 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  26 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.14 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0391  lysine exporter protein LysE/YggA  25.5 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  23.31 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  25.26 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  25.37 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  25.75 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1754  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.58 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0472  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.22 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.464761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.46 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  28.28 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  24.06 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  25.56 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  22.28 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  23.84 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  24.84 
 
 		 220 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  24.58 
 
 		 206 aa  42  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.88 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  25.74 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>