232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7458 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  380  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2268  hypothetical protein  53 
 
 		 208 aa  165  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.73 
 
 		 202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2137  lysine exporter protein LysE/YggA  56.85 
 
 		 202 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2720  LysE/RhtB family amino acid efflux pump  60.61 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1378  lysine exporter protein LysE/YggA  60.61 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69101  normal  0.262549 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  42.03 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.2 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  42.72 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  40.62 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  42.65 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  42.65 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  42.5 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  43.07 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  42.57 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  44.22 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  41.44 
 
 		 205 aa  117  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  38.02 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0804  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.05 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  32.49 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  36.1 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0754  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.754673  normal  0.702985 
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  31.73 
 
 		 212 aa  88.6  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6378  hypothetical protein  37.95 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266594  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  26.13 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  26.13 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  26.4 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  26.37 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  27.92 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  27.92 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  27.92 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  27.41 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  24.49 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  26.8 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  26.8 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  24.49 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  25.38 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  25.38 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  25.38 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  25.89 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  25.38 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  25.38 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  23.98 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  24.87 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  27.84 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3368  lysine exporter protein LysE/YggA  26.47 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  26.92 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  26.92 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  26.92 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  26.92 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  26.92 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  26.92 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  26.92 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  28.96 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  28.96 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  28.96 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  26.92 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  28.96 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  28.96 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0514  lysine exporter protein LysE/YggA  35.76 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.204374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  25.37 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  25.37 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  25.5 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0288  lysine exporter protein LysE/YggA  26.11 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  30.32 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  25.37 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  25.37 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.01 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  25.37 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  26.63 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  26.11 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  26.02 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  28.37 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  27.32 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  22.39 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  28.37 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  25.37 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  25.37 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  25.37 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  25.37 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  25.13 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  28.28 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.17 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  28.28 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  28.28 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  28.28 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.97 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  25.89 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4913  lysine exporter protein LysE/YggA  26.26 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.46 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3009  lysine exporter protein LysE/YggA  26.26 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5357  lysine exporter protein LysE/YggA  26.26 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  28.97 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  28.97 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>