266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2137 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2137  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 202 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  56.85 
 
 		 203 aa  207  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1378  lysine exporter protein LysE/YggA  79 
 
 		 202 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69101  normal  0.262549 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2720  LysE/RhtB family amino acid efflux pump  79 
 
 		 202 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.83 
 
 		 207 aa  137  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2268  hypothetical protein  50 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.52 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  42.86 
 
 		 220 aa  131  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  44.55 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  40.91 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  40.91 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  44.04 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  43.43 
 
 		 210 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  45.6 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  45.6 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  42 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  41.24 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  45.45 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  37.98 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0804  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.28 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  34.03 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  40 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0754  lysine exporter protein LysE/YggA  40.61 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.754673  normal  0.702985 
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  30.46 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6378  hypothetical protein  37.5 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266594  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  28.64 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  29.15 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  28.64 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  30.05 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  30.05 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  27.14 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  28.64 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  32.17 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  32.17 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  32.17 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  32.17 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  32.17 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  32.17 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  32.17 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  32.17 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  32.17 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  32.17 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  32.17 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  32.17 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  32.17 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  30.35 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  24 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  23.62 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  23.5 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  23.5 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  23.5 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  28.95 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  30.46 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  30.46 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  31.03 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  30.46 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  31.03 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  30.46 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  24.08 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  30.46 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  30.46 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  23.56 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.43 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.48 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.26 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  26.32 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  31.4 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  28.16 
 
 		 240 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3067  lysine exporter protein LysE/YggA  32.94 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000755929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  26.78 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  27.94 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  26.37 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  28.42 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.13 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  28.5 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05430  putative chemotaxis protein  27.84 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  28.21 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  26.37 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  26.76 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  21.78 
 
 		 247 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  27.45 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.81 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  31.58 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.27 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  26.52 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  27.78 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  26.52 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  21.78 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0913  lysine exporter protein LysE/YggA  27.75 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  29.41 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  32.43 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  29.35 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  37.79 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  21.29 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  32.6 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  27.91 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  29.71 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.48 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>