More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3570 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 207 aa  391  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  49.27 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  46.31 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  45.81 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  46.31 
 
 		 210 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  46.31 
 
 		 210 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  45.32 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  45.32 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  41.75 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  44.79 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.21 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  45.96 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  41.41 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2137  lysine exporter protein LysE/YggA  43.56 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0804  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.75 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  39.61 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  39.58 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  40.65 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  35.35 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6378  hypothetical protein  38.33 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  30.15 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1378  lysine exporter protein LysE/YggA  48.5 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69101  normal  0.262549 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2720  LysE/RhtB family amino acid efflux pump  48.5 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0754  lysine exporter protein LysE/YggA  37.69 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.754673  normal  0.702985 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2268  hypothetical protein  37.19 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  27.92 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  28.92 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  28.92 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  28.92 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  28.43 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  28.92 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  27.94 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  25.25 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  25.25 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  25.52 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  32.22 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  32.22 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  24.75 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  32.22 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  32.22 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  32.22 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  31.11 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  31.11 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  31.11 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  31.11 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  31.11 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  31.11 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  31.11 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  31.11 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0328  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.872355  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  28.23 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  36.23 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  36.23 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0239  amino acid transporter LysE  25.84 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3368  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.14 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.23 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.42 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  35.25 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  35.77 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.21 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  33.58 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  28.44 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0288  lysine exporter protein LysE/YggA  32.75 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.34 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  33.09 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  33.09 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  28.84 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  22.17 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.34 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  29.7 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  29.19 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  30.94 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  29.41 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  26.67 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  28.29 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  28.29 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  28.29 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  32.41 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  26.7 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  26.7 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  35.07 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  26.7 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.78 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  28.31 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  32.35 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  29.05 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  32.85 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  28.19 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  32.64 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>