294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2412 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 213 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0804  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  81.22 
 
 		 213 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  76.02 
 
 		 221 aa  308  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  75.6 
 
 		 205 aa  278  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.58 
 
 		 202 aa  121  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.68 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  37.56 
 
 		 203 aa  117  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  39.61 
 
 		 207 aa  117  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  35.85 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  33.97 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  40.88 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  40.91 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6378  hypothetical protein  38.67 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 212 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0754  lysine exporter protein LysE/YggA  36.76 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.754673  normal  0.702985 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2137  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  31.25 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2268  hypothetical protein  30.58 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  26.07 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  27.01 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5087  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.52 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  27.4 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  27.4 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  27.4 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  27.4 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  27.4 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  28.14 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  27.4 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  27.4 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  29.01 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  20.85 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  30.1 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  20.85 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  29.93 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  28.08 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  30.15 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  30.15 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  30.15 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  30.15 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  32.73 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  30.15 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  31.67 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  28.24 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  30.15 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  28.46 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  31.67 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  28.26 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  19.91 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  19.91 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  28.26 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  28.26 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  29.65 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  28.26 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  28.26 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  20.38 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  26.52 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  28.04 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.48 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  23.19 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  27.27 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.32 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  30.87 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  26.77 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  27.48 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  22.11 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.21 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  27.54 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  22.11 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  27.32 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.16 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  22.11 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  23.74 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  26.72 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  26.72 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  27.32 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  26.72 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  25.96 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  27.59 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  27.13 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.58 
 
 		 235 aa  52.4  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  30.2 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  24.34 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  30.2 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.53 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>