44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5087 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5087  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 209 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0514  lysine exporter protein LysE/YggA  48.31 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.204374  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  44.84 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.407704  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3303  lysine exporter protein LysE/YggA  45.37 
 
 		 237 aa  91.7  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  hitchhiker  0.000332886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0288  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3368  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3009  lysine exporter protein LysE/YggA  35.63 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4913  lysine exporter protein LysE/YggA  35.63 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5357  lysine exporter protein LysE/YggA  35.63 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  34.55 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.68 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.215816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  37.18 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  34.9 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.04 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  35.12 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0804  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.04 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4097  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4707  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356271  normal  0.57168 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  27.51 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  35.11 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  32.82 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  32.82 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  28.26 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  32.82 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6378  hypothetical protein  31.55 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  32.82 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  32.82 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.05 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  27.42 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  32.06 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.6 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0111  hypothetical protein  37.12 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.76 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1018  lysine exporter protein  27.98 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  0.285378 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.89 
 
 		 207 aa  42  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  27.17 
 
 		 216 aa  42  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  22.51 
 
 		 218 aa  42  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  30.67 
 
 		 201 aa  41.6  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>