66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4707 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4707  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 196 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356271  normal  0.57168 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3368  lysine exporter protein LysE/YggA  87.24 
 
 		 196 aa  328  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5357  lysine exporter protein LysE/YggA  87.82 
 
 		 197 aa  309  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3009  lysine exporter protein LysE/YggA  87.82 
 
 		 197 aa  309  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4913  lysine exporter protein LysE/YggA  87.82 
 
 		 197 aa  309  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0288  lysine exporter protein LysE/YggA  87.76 
 
 		 196 aa  308  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5087  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  37.8 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.81 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  35.82 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  28 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  34.59 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  35.25 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  35.51 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  35.51 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  34.29 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  34.29 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  34.29 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  34.29 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  34.29 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  34.29 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  34.29 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  34.78 
 
 		 219 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  23.98 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  23.98 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  34.51 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  29.31 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  29.31 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  29.31 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  23.98 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  29.31 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  29.31 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  31.93 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  29.31 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  29.31 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.31 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0514  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.204374  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2113  hypothetical protein  45.9 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  30.71 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  32.5 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  32.5 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4188  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.19 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.0417151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  29.13 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  28.79 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  28.79 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  27.89 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  28.93 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1754  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  31.85 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  30 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1018  lysine exporter protein  34.75 
 
 		 218 aa  42  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  0.285378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  30 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  30 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  30 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  30 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  29.13 
 
 		 207 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.03 
 
 		 213 aa  41.6  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0550484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  34.45 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1180  leucine export protein LeuE  31.72 
 
 		 223 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.34 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6378  hypothetical protein  31.13 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3021  amino acid transporter LysE  29.89 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196294  normal  0.164035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>