152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0616 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
210 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.82 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 
207 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  34.76 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  37.88 
 
 
201 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
223 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
210 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.35 
 
 
207 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
210 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  32.49 
 
 
203 aa  99  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2268  hypothetical protein  32.98 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  37.82 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 
212 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  34.9 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  36.26 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0804  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.27 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  36.15 
 
 
221 aa  91.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  29.21 
 
 
212 aa  90.5  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6378  hypothetical protein  31.91 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266594  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0754  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.754673  normal  0.702985 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2137  lysine exporter protein LysE/YggA  34.03 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2720  LysE/RhtB family amino acid efflux pump  37.93 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1378  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69101  normal  0.262549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  28.79 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  29.5 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  29.5 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  29.5 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  29.5 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  29.17 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  29.5 
 
 
208 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  29.5 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  28.72 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  28.72 
 
 
212 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  28.72 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0288  lysine exporter protein LysE/YggA  32.82 
 
 
196 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  26.42 
 
 
229 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  27.92 
 
 
210 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  26.24 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  26.13 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  32.22 
 
 
210 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  32.22 
 
 
210 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  32.22 
 
 
210 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3368  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 
196 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  27.92 
 
 
210 aa  55.1  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  32.22 
 
 
210 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  32.22 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  26.13 
 
 
233 aa  54.7  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  26.13 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  26.13 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  26.13 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  29.01 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  30.06 
 
 
247 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4501  lysine exporter protein (LysE/YggA)  30 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135665 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  31.11 
 
 
223 aa  52  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  31.11 
 
 
215 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  31.11 
 
 
223 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3009  lysine exporter protein LysE/YggA  29.01 
 
 
197 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5357  lysine exporter protein LysE/YggA  29.01 
 
 
197 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  31.11 
 
 
223 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4913  lysine exporter protein LysE/YggA  29.01 
 
 
197 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530342  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  31.11 
 
 
223 aa  52  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.27 
 
 
235 aa  51.6  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  30.56 
 
 
222 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  30.56 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  30 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.38 
 
 
209 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  24.71 
 
 
240 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4912  lysine exporter protein LysE/YggA  28.25 
 
 
213 aa  48.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.15938 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  24.16 
 
 
217 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  24.16 
 
 
217 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  24.16 
 
 
217 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  24.04 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  26.04 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  28.46 
 
 
208 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  24.04 
 
 
225 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  28.46 
 
 
208 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  28.46 
 
 
208 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  24.59 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  25.29 
 
 
223 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  25.29 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  24.04 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  26.58 
 
 
212 aa  45.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  23.68 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4707  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 
196 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356271  normal  0.57168 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  24.73 
 
 
206 aa  45.1  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  23.08 
 
 
225 aa  45.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  26.35 
 
 
215 aa  45.1  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  22.83 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  26.7 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  23.86 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  25.75 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3094  lysine exporter protein LysE/YggA  29.12 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  28.33 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  28.33 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  29.46 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>