179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0472 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
237 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
237 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0913  lysine exporter protein LysE/YggA  98.65 
 
 
222 aa  430  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  93.19 
 
 
240 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  93.72 
 
 
223 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  92.89 
 
 
225 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  91.44 
 
 
221 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  86.04 
 
 
224 aa  370  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  86.16 
 
 
225 aa  370  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  86.16 
 
 
225 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  85.71 
 
 
225 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  85.59 
 
 
225 aa  364  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  86.51 
 
 
217 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  86.51 
 
 
217 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  86.51 
 
 
217 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0887  homoserine/homoserine lactone/threonine efflux pump  79.09 
 
 
229 aa  295  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0613  lysine exporter protein LysE/YggA  79.91 
 
 
226 aa  291  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10064  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3107  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  78.6 
 
 
225 aa  291  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.552982  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  51.2 
 
 
220 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  51.17 
 
 
220 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  51.43 
 
 
217 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  53.33 
 
 
214 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3421  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.08 
 
 
223 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.65 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3289  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.28 
 
 
223 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.67 
 
 
227 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  24.11 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  32.38 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  32.38 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  26.06 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  27.32 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  27.32 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  26.83 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  26.83 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  23.22 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  26.34 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  22.97 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  26.34 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  22.86 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  28.85 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  27.88 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2364  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 
222 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.07679  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  24.38 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  35.71 
 
 
207 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  31.25 
 
 
206 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  31.63 
 
 
206 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  31.63 
 
 
206 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  23.88 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  34.55 
 
 
219 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  29.45 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  28.65 
 
 
206 aa  56.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  23.88 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  23.88 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  34.92 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  23.88 
 
 
211 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  30.97 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  23.88 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  23.88 
 
 
210 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  22.89 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  28.16 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  28 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  34.55 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  23.38 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05430  putative chemotaxis protein  31.29 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  34.38 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  27.88 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  28.16 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  27.88 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  27.88 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  28.16 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  27.88 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  33.64 
 
 
219 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  33.64 
 
 
219 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  26.45 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  28.74 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  28.74 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  28.74 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  28.74 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  29.53 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
204 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  34.69 
 
 
206 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  34.69 
 
 
206 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  34.69 
 
 
206 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  34.69 
 
 
206 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0517  chemotactic transduction protein ChpE  31.29 
 
 
203 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  34.69 
 
 
206 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.41 
 
 
205 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  22.39 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  32.33 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  32.33 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  32.73 
 
 
219 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4166  lysine exporter protein LysE/YggA  31.93 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  0.273019 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  32.14 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  27.33 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  32.74 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.859689 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>